MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402

Total Repeats: 7038

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011999	ATA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011999	ATT	2	6	28	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011999	TG	3	6	117	122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011999	ATT	2	6	164	169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011999	T	8	8	172	179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011999	ATTT	2	8	222	229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011999	TG	3	6	240	245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011999	ATAA	2	8	256	263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011999	TTA	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011999	TAT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011999	A	6	6	315	320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011999	AT	3	6	341	346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011999	AC	3	6	1718	1723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011999	CTATTA	2	12	1791	1802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011999	A	6	6	1813	1818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011999	TA	3	6	1824	1829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011999	T	8	8	3011	3018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011999	ATTA	2	8	5258	5265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011999	AATT	2	8	5285	5292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011999	TAA	2	6	6433	6438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011999	A	6	6	6496	6501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011999	T	6	6	6508	6513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011999	TA	3	6	6532	6537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011999	ATT	2	6	6630	6635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011999	ATC	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011999	AAG	2	6	6714	6719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011999	GAT	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011999	GAC	2	6	6776	6781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011999	AGG	2	6	9844	9849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011999	T	8	8	12552	12559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011999	A	7	7	12560	12566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011999	AAT	2	6	12576	12581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011999	AT	3	6	12595	12600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011999	ATT	2	6	12612	12617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011999	TAA	2	6	12653	12658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011999	A	6	6	12657	12662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011999	GA	3	6	12681	12686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011999	ATA	2	6	15986	15991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011999	AATTTA	2	12	15994	16005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011999	AT	3	6	16007	16012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011999	AGT	2	6	16032	16037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011999	TGG	2	6	16066	16071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011999	TGA	2	6	16088	16093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011999	GGA	2	6	16111	16116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011999	ATTGA	2	10	16135	16144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011999	GA	3	6	16143	16148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011999	ATTA	2	8	16164	16171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011999	T	6	6	16217	16222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011999	AT	3	6	16230	16235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011999	GAG	2	6	16243	16248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011999	TAA	2	6	17583	17588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011999	TA	3	6	17621	17626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011999	AT	3	6	17659	17664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011999	ATT	2	6	17691	17696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011999	A	6	6	17730	17735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011999	GAAA	2	8	18341	18348	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011999	AGT	2	6	18361	18366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011999	GGTGGC	2	12	21200	21211	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011999	TGC	2	6	21223	21228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011999	GAA	2	6	21254	21259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011999	ATT	2	6	21281	21286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011999	ATG	2	6	21288	21293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011999	AGG	2	6	21762	21767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011999	TAAT	2	8	23229	23236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011999	TGT	2	6	23250	23255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011999	A	6	6	23265	23270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011999	A	6	6	23287	23292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011999	ATTA	2	8	23307	23314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011999	TTAA	2	8	23327	23334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011999	TA	3	6	23388	23393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011999	TTA	2	6	23416	23421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011999	ATC	2	6	24798	24803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011999	TAAAA	2	10	24823	24832	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011999	AT	4	8	25781	25788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011999	TAA	2	6	25789	25794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011999	A	6	6	25803	25808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011999	ATT	2	6	25815	25820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011999	AATC	2	8	25859	25866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011999	A	7	7	25874	25880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011999	CGG	2	6	25921	25926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011999	GTG	2	6	25989	25994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011999	TGCC	2	8	26007	26014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011999	AAG	2	6	26061	26066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011999	TCT	2	6	26080	26085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011999	T	6	6	26085	26090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011999	AGT	2	6	26100	26105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011999	ATGAG	2	10	26162	26171	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011999	ATAA	2	8	31699	31706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011999	TTTTTA	2	12	31752	31763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011999	TAA	2	6	31814	31819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011999	GAAT	2	8	31879	31886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011999	CATT	2	8	32380	32387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011999	ATT	2	6	32433	32438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011999	TAA	2	6	32445	32450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011999	GAA	2	6	32455	32460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011999	GGA	2	6	32987	32992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011999	T	6	6	33869	33874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011999	T	6	6	33914	33919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011999	A	6	6	34001	34006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011999	AT	3	6	34012	34017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011999	TAG	2	6	36310	36315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011999	A	6	6	36318	36323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011999	GTAAA	2	10	36344	36353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011999	TAA	2	6	36366	36371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011999	TAA	2	6	36422	36427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011999	T	6	6	36467	36472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011999	CTT	2	6	36474	36479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011999	TTG	2	6	36480	36485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011999	CA	3	6	36535	36540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011999	TGA	2	6	36583	36588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011999	ATT	2	6	36627	36632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011999	AGT	2	6	36651	36656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011999	AT	3	6	36673	36678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011999	TA	3	6	36689	36694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011999	AGG	2	6	36753	36758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011999	ATGA	2	8	37325	37332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011999	GAG	3	9	37345	37353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011999	T	6	6	37714	37719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011999	ATT	2	6	37721	37726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011999	GTTT	2	8	37728	37735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011999	TA	3	6	37746	37751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011999	AAT	2	6	37790	37795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011999	CAG	2	6	37824	37829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011999	GAA	2	6	37846	37851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011999	AAC	2	6	37857	37862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011999	A	6	6	37904	37909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011999	TA	3	6	37949	37954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011999	TAA	2	6	38073	38078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011999	TGAT	2	8	38125	38132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011999	TTC	2	6	38143	38148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011999	AAT	2	6	38156	38161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011999	CAA	2	6	38205	38210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011999	T	11	11	38224	38234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011999	T	6	6	38333	38338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011999	TAT	2	6	38351	38356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011999	ATT	2	6	38369	38374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011999	ATGTT	2	10	38406	38415	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011999	GAA	2	6	39767	39772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011999	ATT	3	9	39799	39807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011999	ATTT	2	8	39834	39841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011999	TAA	2	6	39844	39849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011999	AAT	2	6	39850	39855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011999	TGA	2	6	39856	39861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011999	ATA	2	6	39862	39867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011999	AGG	2	6	39882	39887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011999	ATG	2	6	40508	40513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011999	AG	3	6	40552	40557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011999	TAA	2	6	40564	40569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011999	AATT	2	8	41101	41108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011999	CT	3	6	41764	41769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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472	NC_011999	T	6	6	128586	128591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_011999	AT	3	6	128606	128611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_011999	ATC	2	6	129980	129985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_011999	CAT	2	6	130156	130161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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487	NC_011999	ACA	2	6	130287	130292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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490	NC_011999	T	7	7	131032	131038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_011999	TCC	2	6	131675	131680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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499	NC_011999	TAT	2	6	133547	133552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_011999	TAA	2	6	134285	134290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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